Dans son chapitre III, INSPIRE présente des règles de mise en œuvre permettant « l’interopérabilité des données et services de données géographiques». Cela impose aux États membres d’harmoniser un ensemble conséquent de thèmes de données en les dotant par exemple de plusieurs attributs spécifiques.
Les thèmes de l’annexe 1 et 2 fournissent le cadre de travail dans lequel les autres données thématiques sont généralement référencées et pour lequel le plus haut niveau d'harmonisation à travers les frontières administratives et juridiques est nécessaire. Établir des spécifications de données harmonisées pour ces thèmes de données est par conséquent un objectif prioritaire. La distinction entre les annexes 1 et 2 est liée à un horizon temporel différent pour la livraison de spécifications harmonisées.
Il ne faut cependant pas sous-estimer les spécifications harmonisées pour les données de l'annexe 3 afin de les rendre géométriquement cohérentes : elles sont les plus utiles pour les politiques environnementales.
Le calendrier précise que ces règles d’harmonisation et d’échange seront adoptées dans un délai de 2 ans à compter de la date d’entrée en vigueur de la directive (2009), et dans un délai de 5 ans (2012) pour les données des annexes 2 et 3.
La mise en œuvre de ces règles diffère selon la disponibilité des thèmes de données. Les données (en regard des annexes) existantes devront être conformes dans un délai de 7 ans à compter de l’adoption des règles. Par contre, lorsque qu’elles sont nouvellement collectées ou restructurées en profondeur, le délai tombe à 2 ans.
L’équipe travaille sur les problématiques suivantes :
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rédiger des spécifications pour l’harmonisation des données et des services,
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rédiger des arrangements pour l’échange de données géographiques.
Pour l’ensemble des données des annexes 1, 2 et 3, les spécifications harmonisées des données devront comporter la définition et la classification des objets géographiques et la manière dont ils sont géoréférencées.
Les règles seront plus contraignantes pour les données des annexes 1 et 2, puisque les aspects suivants doivent être mis au point :
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un cadre commun pour l'identification unique des objets géographiques avec lesquels les moyens d'identification nationaux peuvent être mis en correspondance afin de garantir leur interopérabilité,
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le lien entre les objets géographiques,
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les attributs essentiels et les thésaurus multilingues correspondants communément requis en ce qui concerne les politiques susceptibles d'avoir une incidence sur l'environnement,
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des informations sur la dimension temporelle des données,
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la mise à jour des données.
Atteindre ces objectifs impose à l’équipe de travailler sur :
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la définition d'un modèle conceptuel générique pour les thèmes de données des trois annexes. Ceci inclut la définition des représentations géométriques topologiques et temporelles, les relations spatiales et temporelles, les identifiants uniques, la référence à un système de coordonnées spatiales et temporelles tout autant que les thesaurus multilingues ;
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des guides d’utilisation pour utiliser ce modèle générique dans le développement de spécifications de données spatiales ;
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des règles de généralisation pour traiter des questions de changement d’échelle (incluant de fait agrégation, désagrégation, simplification...) ;
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et des règles d’encodage (en support à l'échange de données spatiales).